Oi Joice, tudo bem?
Tem várias formas de salvar as coisas no Z-Brush, pois pode salvar o arquivo, o Tool e o Document.
O comum é salvar os objetos que modela como Tool no menu da lateral direita, lá você tem o Save As para salvar o objeto e o Load Tool para ler o objeto salvo, como mostra a imagem em anexo.
Neste caso o objeto será salvo no formato ZTL do Z-Brush Tool.
Você também pode importar objetos de outros programas ou exportar o que modelou no Z-Brush para outros programas pelos botões Import e Export do menu Tools, marcados na imagem em anexo.
Você salvou o seu modelo como Tool em ZTL ou usou o File > Save As ou o Document > Save As?
Não é comum o Z-Brush corromper arquivos de modelos 3D em STL, eu nunca vi acontecer.
Se puder postar a imagem com a mensagem de erro será mais fácil identificar o problema.
Abração e tudo de bom.
André Vieira