Oi Marina, tudo bem?
Se você está usando Bones para animar a barba, terá que fazer controladores neles para poder animar manualmente também, pois é a única forma de ter controle total.
Mas você pode também usar o Reaction Manager para fazer isso com mais facilidade e automatizar um pouco, o ideal seria fazer com Expressions.
Neste tutorial você pode ter uma noção melhor sobre estes recursos: http://www.tresd1.com.br/artigos.php?t=15385
Agora, se você fizer a barba com o Hair And Fur, que é o mais indicado nestes casos, então poderá usar os recursos do Hair And Fur para a barba realmente reconhecer a malha da barriga automaticamente e não penetrar.
Com o Hair And Fur você pode criar uma barba tipo cartoon substituindo os fios por mechas modeladas em 3D, mas fica bem mais pesado.
Abraços