Oi Auleu, tudo bem?
Seja bem vindo ao nosso site, espero que participe bastante aqui com a gente.
Sobre a sua dúvida, dependendo da transformação que deseja fazer, o efeito deve ser criado com composição com Morph 2D, desta forma você pode transformar qualquer coisa.
Em 3D se usa Morph para fazer a animação de um rosto, por exemplo, para passar pelas várias expressões do rosto, então, a forma é a mesma, os vértices são os mesmos, só muda a posição para fazer as expressões, assim dá certo.
Se for transformar um carro num avião, por exemplo, deve ser feito com Morph 2D e fica muito bom.
O nosso amigo Feitosa postou ótimos tutoriais de Combustion em vídeo e um deles explica como fazer Morph.
O link é este: http://www.tresd1.com.br/viewtopic.php?t=27577
Abraços