Oi July, tudo bem?
É bem simples, provavelmente o tutorial explica como animar o deformation para animar a subtração que você fez do túnel na caixa.
Seleciona o objeto resultante da operação booleana e entra no painel Modify.
Dentro dele terá no último menu a opção Scale, este menu se chama Deformations.
Clicando nele aparece uma janela com um gráfico que é muito comum no Max.
Neste gráfico você terá que adicionar pontos e movimentá-los para criar irregularidades na deformação, podendo animar isso.
Ou então, vai criar dois pontos e zerar os dois, animando os pontos até 100 novamente, assim, o túnel irá se formar na caixa.
Se for essa última opção, tem uma forma muito mais fácil de fazer, basta animar o operador do Boolean, por isso creio que irá fazer a primeira opção.
Você pode conhecer melhor essa técnica no tutorial "Loft Scale", aqui na Três D1, o link direto é http://www.tresd1.com.br/conteudotutoriais.php?t=15247
Abraços