Oi gente, tudo bem!
Eu estava tentando fazer do jeito que o tiagodmed descreveu, mas quando eu arrastava o layer sobre a outra imagem, aparecia o retangulo entretanto o layer não era passado. Só percebi que tinha algo errado quando fui seguir a idéia do Abaiao e quando surgiu a janela não havia a opção na lista de mandar para a imagem que eu queria. Quando fui olhar seus canais de cor só havia um com todas e ainda não conseguia nem criar um layer dentro do arquivo. Tentei salvar a imagem em .tga para ver resolvia, mas não deu certo. Foi quando pensei em salvar o arquivo num formato que não grava informações (.jpg) e para garantir fiz no Corel Photopaint e agora quando abro esse novo arquivo no Photoshop ele funciona direito.
Resolvi meu problema, mas alguém sabe porque isso aconteceu ou algum jeito de resolver esse problema dentro de algum parâmetro do própio Photoshop?