Oi gente, tudo bem?
Realmente, se for deformar o objeto, não dá para fazer só com Extrude, só com Shell ou só com Bevel.
Nunca vai dar certo porque nenhum destes comandos cria faces na parte de cima e de baixo da extrusão, apenas nas laterais.
Pode fazer com Extrude ou Bevel, mas vai ter que transformar em Poly e modelar de novo a parte de cima e de baixo. Para poder criar as faces necessárias para deformar.
A melhor forma de fazer é como o Ziriguidum disse, basta chanfrar e usar o Insert para criar essas faces, com pequenos ajustes nos vértices vai ficar bom e com a resolução necessária para deformar.
Agora, a outra opção é usando o Surface, como o Roger disse, eu acho muito mais trabalhoso do que modelar em Poly, mas é uma opção, ele geraria as faces necessárias na parte de cima e de baixo para poder deformar depois.
Ainda poderia ser feito em Nurbs e transformado em Poly depois para animar, assim também seria gerado as faces na parte de cima e de baixo do objeto.
Abraços