Oi Elton, tudo bem?
Eu nunca vi dar problema nesta parte em nenhuma versão do 3ds max.
Verifique se está procedendo corretamente.
Crie uma esfera na cena, selecione-a, segure a tecla Shift do teclado e arraste a esfera com o comando Move.
Vai aparecer uma janela. Escolha a opção Instance.
Seleciona e esfera copiada e aplique um Modify Noise, por exemplo, apenas para aplicar alguma deformação nela.
A esfera original vai ser deformada também.
Agora, apague o Modify Noise e delete a esfera copiada.
Selecione a esfera original e faça o mesmo procedimento, mas agora escolha a opção Reference.
Aplique o Modify Noise na cópia, assim, só a cópia é modificada, a esfera original continua igual.
Delete o Modify da cópia e aplique na esfera original.
Agora, tanto a esfera original quanto a cópia recebem as deformações.
Abraços