Oi Keymax, tudo bem?
Se você estava estudando Bones, deveria continuar com os estudos até dominar bem o sistema de Rig de estruturas Bones, porque é a melhor forma de animar personagens e objetos com ligações hierárquicas, pois permite personalizar tudo da forma que quiser, oferecendo liberdade total.
O Biped é muito mais limitado, tudo que é muito automático é mais limitado.
Para usar Layers, como perguntou, é bem simples, basta clicar no botão Creat Layer no menu de Layers do Biped no painel Motion.
Um novo Layer é criado independente dos Keys padrões que o CS gerou com os Footsteps.
Agora é só ligar o AutoKey e animar a mão do Biped como desejar, colocando os Keys no tempo que desejar, animando normalmente como qualquer objeto no Max.
Quando a animação chegar nos Keys deste Layer, fará uma transição suave da animação do Biped para a animação do Layer.
Quando sair dos Kayer, vai voltar para a animação do Biped.
Abraços