Oi Evandro, tudo bem?
Isso acontece pela forma que o Bone está na estrutura e dos Fins.
Se os Fins forem muito grandes e maiores que o comprimento do Bone, então, o Envelope ficará no sentido do Fin.
Porque os Bones são volumétricos, o envelopamento padrão é feito com base nas dimensões e ligações deles.
É justamente as ligações que também podem criar este tipo de orientação, se for o Bone no final de uma cadeia, ele pode ficar com o envelope nessa posição.
Mas seja como for, você pode ajustar manualmente a posição do envelope e colocar na orientação que quiser, precisa clicar no centro do Gizmo do Envelope para selecioná-lo.
Mas acho que você sabe isso, só que não queria ter que fazer esse ajusta, né? :)
Abração