Oi Cursi, tudo bem?
Você está fazendo dois procedimentos diferentes para o mesmo fim.
Se você separa em vários IDs e usa o UVW Map mapa mapear, não precisa do Unwrap, neste caso você vai ter vários mapas diferentes e vários materiais diferentes, então, cada material terá o seu próprio mapeamento no objeto.
Agora, se você usa o Unwrap UVW, normalmente não vai separar o objeto em IDs, porque vai fazer um material só com uma textura só para todo o objeto, como o personagem de um Game, por exemplo, que toda a textura é uma coisa só, tanto pele quanto roupa e tudo mais faz parte da mesma imagem e não é dividido em IDs.
Depois que você tem a malha aberta pelo Unwrap UVW, você precisa arrumar a malha na área útil da textura para poder pintar em cima e fazer as emendas certas.
Abraços