Oi Marcoz, tudo bem?
Tudo depende do que você deseja fazer e de como mapeou.
Se mapeou com o UVW Map, terá as partes da malha divididas em IDs e vai aplicar materiais Multi/SubObject.
Neste caso você vai ter que pintar uma textura para cada parte e em várias destas partes pode ser melhor usar mapas procedurais.
Mapas procedurais são componentes para criar materiais, igual as texturas, que são imagens, mas os mapas procedurais não são imagens, são criados por programação, são equações que formam uma imagem ou criam um efeito.
Por exemplo o mapa Noise do 3ds max, ele é feito por equações matemáticas e forma um padrão de rugosidade em tons de cinza. Entende o que é mapa procedural?
Criando um material todo com mapas procedurais, normalmente nem precisa de mapeamento onde ele será aplicado.
Agora, para personagens o mais comum é mapear com o UnWrap UVW, que é mais complexo e trabalhoso, mas permite abrir a malha 3D da forma que você quiser e assim ter a malha 3D como referência para a pintura.
Depois que você abre a malha 3D na janela de edição do Unwrap UVW, você salva essa imagem da malha aberta e abre no PhotoShop, onde vai pintar sobre ela vendo onde está cada parte do modelo, isso permite que você detalhe bem melhor.
Você pode usar outras imagens, por exemplo, no caso de um personagem, pega foto de pessoas, recorta o olho e coloca na imagem da textura usando a malha como referência, assim você monta o corpo todo com partes de fotos.
O PhotoShop é uma das melhores opções para fazer isso.