Hummm...
Assim, a experiência que eu tenho com esse problema é apenas de que ele acontece quando você de alguma forma tenta deslocar o objeto no espaço depois que ele recebe o skinwarp. O único deslocamento que ele deve sofrer é aquele causado pelo objeto que faz a sua deformação. Ou seja, a idéia é de que não se deve aplicar nenhuma rotação, movimentação ou escalonamento depois de este ter recebido o skinwarp, seja manualmente, seja por link, por wire ou por script.
Se a questão é como concertar o problema depois que ele acontece, então a única coisa para ser feita seria deletar o skinwarp e aplicar novamente, a partir daí evitando de movimentá-lo pelo espaço.
Se o problema for outro, aí eu não vou poder t ajudar, porque é só nesta circunstância que conheço em que o skinwarp dá essa "rasteira" nos artistas. Da primeira vez que isso acontece realmente é estranho, mas depois que eu evitei de mexer no objeto depois de receber o skinwarp nunca mais tive esse problema.