Guga,
Só para deixar claro, o que você quer montar é uma workstation, renderfarm é outra coisa e muito mais cara. Até vou editar o título do seu tópico para ficar mais fácil do pessoal entender e responder.
Influencia um pouco, porque quando a placa-mãe aceita mais clock ela além de deixar o sistema mais estável ela tem uma dissipação de calor maior, coisa que na hora do render é gerado muito calor. O problema é que as placas low-end (com video onboard), são bem limitadas e principalmente quando estamos falando de desejo de futuros upgrades.
Bom, já que compraste o Q9550, então pense em placas já com DDR3 para ter um pouco mais de desempenho, hoje o valor de uma DDR3 é semelhante a uma DDR2. Procure se ater as memórias das marcas Corsair, OCZ, G.Skill, Cruscial Ballistic, GeIL, Kingstone e Patriot. Estas são garantidas.
Uma placa boa que tem um excelente Custo x Benefício é a Biostar Tpower X48, é uma placa hi-end que aceita muito overclock.