Um bichinho desses não te resolve?
http://www.nzxt.com/product/detail/77-sentry-2-fan-control.html
http://www.nzxt.com/product/detail/78-sentry-lx-fan-control.html
Agora se os coolers estão acelerados, deve ser porque os procesadores estão a mil. O que o monitor de recursos do windows informa a cerca do uso dos processadores? (Menu iniciar, Acessórios, ferramentas do sistema, monitor de recursos)
A sua placa mãe é padrão SSI EEB, o gabinete indicado é o cooler master Cosmos e eu indicaria 2 water coolers corsair h100i pra refrescar os processadores. Também acho bom uma placa de vídeo nvidia parrudinha final 60 ou superior, pros processadores dividirem o trabalho deles com a plaaca de vídeo e aí trabalharem menos.
Gabinete
http://www.coolermaster.com/case/full-tower-cosmos-series/cosmos-2/
Cooler
http://www.corsair.com/pt/cpu-cooling-kits/hydro-series-water-cooling-cpu-cooler/hydro-series-h100i-extreme-performance-liquid-cpu-cooler.html
A série Hydro da corsair tem suporte pra socket 1366, não sei dizer se o socket 1366 do seu xeon possui alguma diferença pro LGA do i7, em termos de encaixe do water block. Pessoalmente, acho que não.
Eu sempre gostei de montar as minhas máquinas. Comprei meu primeiro pc em 88, desmontei pra ver como era, daí pra frente sempre compro as peças e monto. Máquina comprada já montada sempre vem abaixo das expectativas ou mais cara ou ainda as duas coisas juntas.