Seja bem vindo aqui cara, mas vc não precisa separar em partes pra trocar texturas, vai complicar desse jeito.
Seleciona o objeto, entra no material editor, clica no icone Get Material e marca a opção Selected no material/map browser, ai vai aparecer o material do objeto selecionado, clica nele pra colocar no material editor.
Ai é só você trocar o material pelo que vc quiser, clicando no botão do material que aparece no canto superior direito do material editor,
Ou pode fazer outro material multi/sub-object com a mesma quantidade de submateriais e aplicar no objeto, vai aceitar também.
Essa FAQ aqui mostra esse lance de gerenciar materiais: http://www.tresd1.com.br/frequentes.php?t=19802