Cara! O Character Studio vem evoluindo muito em cada versão. Mas, ao meu ver, se vc precisar fazer uma animação sem muita necessidade de detalhes, o Character vai ser ótimo e bem rápido para isso. Acredito também que muita gente use ele para evitar aquele grande trabalho no "rig" de um personagem com bones. Mas o rig com bones apesar de demorado e precisar de muita cautela, pois se errar pode precisar começar do zero, permite muito mais detalhamentos numa animação.
Ultimamente utilizo as duas técnicas num mesmo rig. Utilizo o "Biped", do Character, como mesh no lugar dos bones e crio os IK's onde são necessários.
Espero ter respondido sua pergunta!