Oi Bisewski, tudo bem?
A Skylight é uma luz secundária, não pode ser usada sozinha na cena nunca, sempre tem que ter uma luz normal.
A SkyLight não serve para estes efeitos, não serve para composição, é uma luz limitada, não tem os mesmos recursos das luzes comuns.
Nestes casos, tem que fazer como era antigamente, simular SkyLight com luzes Omni.
Agora, isso é só sobre a sombra, obviamente, porque GI não fica guardado no Matte, Matte é só para alpha, não aceita RGB, só tem um canal de cores e não 3.
Para fazer composição envolvendo GI depende de muito mais coisa, depende de outras técnicas, depende de renderizar em elementos e compor o GI no Combustion ou no After Effects depois.
Abraços