Oi Sassa, tudo bem?
Realmente é difícil responder tudo isso detalhadamente, porque tem muitas coisas envolvidas.
Vale lembrar também que animação de personagens é a última coisa que se aprende no Max, porque é disparadamente o mais difícil de tudo e depende de conhecer tudo sobre animação antes.
Mas respondendo as suas perguntas de forma mais básica:
1- praticamente nenhuma interação de personagens é feita com o Reactor, apenas em raríssimos casos, só quando realmente não tem como animar normalmente.
Normalmente a animação é feita com Key Frames, modificando a posição, rotação, escala ou valores dos recursos e criando Keys para definir estas transformações.
Mas se um personagem é atropelado, como você vai conseguir animar pensando quadro a quadro? Não vai ficar bom, não vai ficar realista, isso precisa ser calculado usando forças físicas, só neste caso que vai usar o Reactor.
2- A mesma coisa da resposta 1, todo personagem é animado criando Keys conforme muda a posição, rotação, escala ou valores dos recursos em cada parte do personagem. Por isso que saber animar é o mais importante de tudo.
3- Você pode fazer coisas tremer com o controlador Noise, ele é aplicado pelo Curve Editor ou pelo painel Motion, ainda tem o Script Handcam que faz essa simulação, você encontra no site www.scriptspot.com
4- Este tipo de simulação é feita com o RagDoll, o Hinge, Rigid Bodies e outros recursos do Reactor, mas dá para fazer muito melhor com a ajuda do programa Endorphin, que é próprio para o cálculo físico de corpos orgânicos, então, você pode calcular nele e importar o cálculo no Max, mas obviamente é muito mais complexo do que fazer com o Reactor.
5- Não, RagDoll é um dos recursos do Reactor.
6- Não, o Biped nunca é inserido em sistemas dinâmicos, porque as interações e links entre as partes do Biped ou de qualquer outra estrutura hierárquica não serão reconhecidas e não serão respeitadas pelos sistemas dinâmicos.
Deixando claro que o Dynamics não é o Reactor, são coisas diferentes mas fazem os mesmos efeitos. O RagDoll e os recursos do Reactor não funcionam no Dynamics do 3ds max, apenas no Reactor. O Dynamics não consegue simular corpor orgânicos, apenas corpos rígidos.
Se você já tem um grande domínio de animação no 3ds max e quer começar a estudar personagens, leia os 3 tutoriais sobre Bones aqui do site e o tutorial sobre Reaction Manager, Wire e Expressions, tem vários outros tutoriais de leitores sobre Rig também.
Os tutoriais de Bones estão nesta página: http://www.tresd1.com.br/conteudotutoriais.php?t=14630&&start=30
Abraços