Oi Turcedor, tudo bem?
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O Maya e o Max fazem a mesma coisa, são programas para 3D, ainda tem muitos outros, como LightWave, Cinema 4D, SoftImage XSI e Houdini, para citar os mais famosos.
O melhor programa 3D do mundo é o SoftImage XSI, mas quase ninguém usa, muito menos aqui no Brasil.
O programa 3D mais popular e mais usado do mundo é o 3ds max, é o que você encontra mais informações e literatura.
Se vai trabalhar no Brasil, a melhor opção é escolher o 3ds max.
Sobre plug-ins para animação de personagens, você não precisa de nenhum, o 3ds max oferece todas as ferramentas para fazer isso, mas precisa estudar muito, porque é a parte mais complexa do programa.
O Character Stuio é um recurso que acompanha o 3ds max para facilitar animações de personagens que não precisam de customização, mas também aceita customização, só que neste caso tem que conhecer toda a parte que disse anteriormente e neste caso é melhor fazer toda a estrutura customizada, usando Bones e Rig convencionais.
Existem plug-ins de terceiros para animação de personagens, como o PupetShop e o CAT.
E existem programas próprios para animação de personagens, como o Motion Builder, mas a pessoa tem que saber animar primeiro no 3ds max para depois partir para estas outras opções, e quando isso acontecer, verá que não precisa, porque com o que tem no max você faz tudo que quiser sem problemas e sem ter que ficar intercambiando animação entre softs.
Abraços