Oi 3DVisual, tudo bem?
Depende muito do que você pretende fazer, porque tem formatos diferentes que pode usar.
Por exemplo, se fez uma animação com efeitos de luzes e materiais, com reflexos, refração, sombras suaves e tudo mais, não tem como exportar em vetor para o Flash, até tem, mas ficaria mais pesado do que um AVI sem compressão.
Neste caso a única opção é exportar a animação em arquivo de vídeo AVI para importar no Flash e converter para Flash Video.
Agora, se é uma animação com objetos simples, cores chapadas e tal, como é comum em imagens vetoriais, então, você pode usar algum plug-in para renderizar a animação direto em vetor e salvar em SWF.
O plug-in mais famoso para isso é o Swift3DMax, da Electric Rain, mas é um plug-in comercial, não tem versão gratuita.
Ainda existem outros, como o Vectra 3D, o Final Toon, o Illustrate, entre outros.
Abraços