Oi flightman, tudo bem?
Seja bem vindo ao nosso site, espero que participe bastante aqui com a gente.
Sobre a sua dúvida, realmente não se deve encher o material editor com materiais Multi/Sub-Object, porque ele não é para conter todos os materiais da cena, se fosse, teria muito mais Slots.
Usamos o editor de materiais apenas para editar o material que será aplicado na cena naquele momento, depois, pode arrastar um material cinza padrão para cima dele e boa, começa a fazer outro material.
Se precisar de algum material aplicado na cena, é só clicar em Get Material, mudar para Scene no quadro Browse From do lado esquerdo e pronto, todos os materiais aparecem para você.
Na parte superior da janela você pode mudar para mostrar os materiais como esferas, igual o Material Editor.
E se quiser colocar o material de novo para edição no Material Editor, é só dar dois cliques nele.
Super fácil e super prático.
O tutorial que o Mucio indicou explica todos os detalhes sobre o Material/Map Browser.
Abraços