Oi gente, tudo bem?
Ziriguidum> Como te disse, depende da complexidade da modelagem nestes locais, se tem muito polígono depende de mais cuidado, e os problemas aprecem mais facilmente, se tem menos polígonos os problemas aparecem menos, e depende também dos movimentos que vão fazer.
Agora o correto mesmo é deixar os bones sempre passar um pouquinho, vai ver isso em qualquer tutorial de bones que ler na internet.
O Cross Section não tem nada a ver com isso, ele é apenas para refinar o envelopamento daquele Bone, pois todos os bones tem envelope, mesmo que não tenha Mesh para envelopar, e os Bones sempre estão envolvidos pelo Envelope, só o Mesh que pode não estar, criando mais Cross Sections pode refinar o envelopamento deste Bone, permitindo refinar a deformação do Mesh, mas o envelope tem que envolver o Mesh, caso contrário fica fora da atuação dele, não recebe as deformações do Bone, seria o mesmo que não ter o Bone ali.
Arquiteto3D> Faz uns testes antes com um cilindro, você pega a manha rapidinho, cria um braço com um cilindro, coloca bones e envelopa, ai dobra o braço e tente arrumar o problema de deformação na junta, fazendo isso é a base de tudo, pode ajustar todas as deformações de juntas dessa forma.
E quando for fazer o corpo completo, deixe os bones das extremidades passarem um pouco para fora, não tem erro.
Abraços