As vzs o flatten só não resolve. Dá muito trabalho no autocad corrigir. De vez enquando pego umas curvas de nível feitas por topógrafos que fazem as curvas , cada qual numa cota (Z), mas, depois, colocam na vista top do autocad, que pra maioria dos usuarios, é 2D (x e y), e saem fazendo os desenhos finais, ruas, etc... O resultado é esse, desastroso até pra eles, às vezes. O único jeito, quando com flatten não funciona é trabalhoso demais, mover ponto por ponto.
Pro max, sugiro, importar esta @#%$#@ e ativar snap 2d, na vista top e redesenhar.
Por isso gosto de usar no autocad poliline (spline pro max), e redesenhar por cima do trabalho original, num layer novo. às vzs deletando ou desligando os originais. Ensinam cada barbaridade aos cadistas que vou te contar!!!