A Engine Unity 4 tem como principal novidade o Mecanim, um sistema completo para ajustar animações de personagens nos Games como Retarget, meclagem de Clips, estabilização dos pés e reconhecimento de trajetórias, mas também tem outras melhorias como suporte a DirectX 11, publicação em Flash e Linux, aprimoramento no sistema de partículas Shuriken e Real-Time Shadows em plataformas móveis.
Você pode ver a lista completa de novidades no site da Unity.

Veja abaixo o vídeo de demonmstração do Mecanim: