Oi Sampras, tudo bem?
Essa é uma questão muito importante sobre o Glow e qualquer efeito de Vídeo Post.
Ele usa os pixels da imagem para aplicar o efeito, se tem um objeto na frente, mesmo que seja totalmente transparente, o pixel não será mais o do objeto que recebe o Glow e não vai aparecer o efeito.
Por isso que este tipo de efeito deve ser criado em composição, não diretamente em 3D, principalmente se for em animação.
É necessário renderizar o objeto com Glow separadamente e depois os demais objetos em Layers para compor a imagem final num programa de composição, se for uma imagem só, pode usar o PhotoShop, se for vídeo, pode usar o Combustion ou o After Effects.
Abraços