Oi Rogério, tudo bem?
Se é uma aplicação interativa em 3D, não tem que fazer animação, porque quem vai "animar" é o usuário que tiver controlando a interatividade.
Você faz apenas a cena 3D, pode até fazer animações de detalhes para "chamar" por meio de programação no Director, como a abertura de uma porta quando o cara clicar nela, por exemplo.
Neste caso você faz a animação da porta em poucos Frames e "chama" essa animação quando o usuário clicar em algo.
Quando exporta em W3D pode conter as texturas, mas precisa ser JPG ou BMP e ter o tamanho exato do objeto, não vai aceitar os recursos de ladrilhamento do menu Coordinates do material e nem nada disso.
Não vai aceitar mapas procedurais e recursos avançados de material, apenas imagem no Diffuse.
Abraços