O [i:30e8a12444]Morpher[/i:30e8a12444] considera os índices dos vértices para gerar as transíções, ou seja, ele apenas move vértices. Portanto, a única opção plausível seria mesmo modelar o objeto com mais vértices primeiro e depois alterá-lo até que se adaptasse ao segundo. Entretanto, sugiro modelar uma terceira forma intermediária entre os dois, criar alvos de cada um dos dois que coincidam com esta malha intermediária e, depois, durante a animação, trocar de objeto animando a opacidade de ambos. Assim, não é preciso se preocupar com número de vértices na modelagem.
Ou seja:
(obj01 ---mphr---> malha intermediaria)(malha_intermediaria ---mphr---> obj02)