KF,
Se você puder investir em uma QuadroFX manda ver, senão pega uma da GeForce série 200 tipo uma GT285. Já sobre a placa-mãe, compra via Internet mesmo a placa-mãe. Dá uma olhada neste tópico (
http://www.guiadohardware.net/comunidade/lojas-informatica/900576/) que tem várias lojas que vendem via Internet. Eu aconselho comparar na Waz, Oficina dos Bits, Noli, E-Armazem, Smartdata, Kabum... na Plug-Informática é a mais barata, porém quando não tem a pronta entrega pode demorar muito pra chegar, só pegue se tiver a pronta-entrega. Eu tive um problema ano passado quando comprei dois kits de memória com eles, em 40 dias não me entregaram e eu daí pedi reembolso, mas em menos de 24 Horas estava na minha conta.
E uma coisa IMPORTANTÍSSIMA, pegue um Cooler bom, porque com uma placa de video como uma GT285 a coisa vai esquentar dentro do gabinete. E o gabinete também deve ter espaço para colocar vários fans e exaustores para criar um bom fluxo de ar dentro.