Oi Marco, tudo bem?
Não é por causa do material de trás não, ele não vai influenciar nisso.
Se você testou o mapa de Alpha e ele está correto, verifique as configurações de Output e RGB Level no menu Output do Bitmap, ambos devem estar com 1.
Qual material você está usando para criar este mapa de opacidade? Use um material Standard.
Se nada disso der certo, seria legal abrir a imagem no PhotoShop, selecionar o canal Alpha na ficha Channels e teclar CTRL+C.
Depois tecla CTRL+N para criar um arquivo novo e em seguida tecla CTRL+V, salva este arquivo com outro nome e usa ele no mapa de opacidade, para ficar separado da imagem, assim, terá mais controle e poderá ajustar o tom se for necessário.
Abraços