Oi Feeh, tudo bem?
Fica complicado para eu baixar o arquivo e estudar qual é o problema, pois o tempo é escasso.
Mas eu concordo com as colocações do Super Max, exceto sobre os materiais Architectural não servirem para o Mental Ray, servem sim, tem uma livraria de Shaders do Mental Ray só para converter estes materiais para ele.
O problema é na forma de compor o material, da mesma forma que no material Standard vai criar estas manchas pretas dependendo da forma que criar o material, no Architectural também vai acontecer a mesma coisa.
Ai é uma questão de saber criar materiais sem usar as gambiarras que usamos no render padrão, porque o Mental Ray não aceita estas coisas.
Mas o ideal é usar materiais Standard ou Raytrace, evita problemas de configurações incompatíveis.
Agora, se você usa o 3ds max 9, então, não precisa de mais nenhum material, passe a usar apenas o material Arch&Design, ele é ótimo e vai permitir criar qualquer tipo de material para maquete com facilidade.
Abraços