Tente usar boolean (Painel Create > Compound Objects > Boolean), dai em Operations escolhe Union e depois é só clicar em Pick Operand B e clicar no outro objeto... porém, o melhor mesmo seria modelar na mão mesmo... Pois embora o boolean una os objetos, sempre vai deformar na hora de suavizar, a não ser que se trabalhe bastante em cima, o que acaba não compensando pelo trabalho. Agora se a idéia é fazer como se fosse a solda dessas junções, você pode usar o Connect (Painel Create > Compound Objects > Connect), mas as formas tem que estar como Editable Poly e ter as faces onde serão conectadas excluídas.
Para que fique mais facil de te ajudar, poste alguma imagem mostrando onde você está tendo maiores problemas...
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