Oi 3dsmax, tudo bem?
Todo mundo que está iniciando com modelagem sofre muito com o Cut, é super normal, aconteceu com todo mundo aqui, pode ter certeza.
É pura questão de prática, depois de um tempo sempre corta perfeitamente de primeira e sem problemas, tem que clicar no lugar certo e todos os polígonos que participam do corte tem que estar visíveis.
Agora no começo tem algumas coisas que pode usar para evitar problemas, depois de um tempo pode ir direto mesmo que não dá mais pau.
Uma dessas coisas é ligar o Ignore Backfacing, logo no início do painel do Edit Mesh, a outra é ligar um Snap, por exemplo, quer cortar um polígono no meio, então liga o Snap Midpoint e corta com o Cut no Sub-Object Edge, vai pegar direto no meio delas e não vai ter erro, quando não for usar um ponto específico pode usar o Snap Vertex ou mesmo o Edge, assim vai cortando de vértice em vértice ou de Edge em Edge.
Testa ai e depois me fala se melhorou.
Abraços