Oi Royal 3D, abaixo vou colar a resposta do André.
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Oi, tudo bem?
É bem simples, primeiro use o Attach para unir todos os Meshes no mesmo objeto, depois aplique o Unwrap UVW, abra a janela do editor de UVs e acesse o menu Tools > Pack UVs.
Assim, todos os mapeamentos previamente aplicados nos objetos serão distribuidos pela área útil da textura, evitando que um fique sobre o outro.
Por fim, aplique outro Unwrap UVW em cima do que já está no objeto e acessando o menu Modify, mude o número do Map Channel para 2.
Vai aparecer uma mensagem perguntando se deseja mover ou abandonar o mapeamento atual, escolha a opção Move para mover o mapeamento do canal 1 para o canal 2.
Agora você tem o objeto com os dois mapeamentos necessários para usar em Engines, o primeiro para a textura e o segundo para o Lightmap.
Eu sugiro que antes de exportar em FBX para a Engine você converta tudo em Mesh ou dê um Collapse All, pois em algumas Engines pode ter problemas se exportar com os dois Unwrap juntos.
Abraços e tudo de bom.